พันธะเปปไทด์เป็นพันธะโควาเลนต์ที่สร้างขึ้นระหว่างโมเลกุลสองโมเลกุลเมื่อกลุ่มคาร์บอกซิลของกลุ่มหนึ่งทำปฏิกิริยากับกลุ่มเอมีนอีกกลุ่มหนึ่งผ่านการควบแน่น (หรือการคายน้ำซึ่งนำไปสู่การกำจัดโมเลกุลน้ำ )
โดยปกติแล้วพันธะของเปปไทด์จะเกิดขึ้นระหว่างกรดอะมิโนสองชนิด
เนื่องจากในโมเลกุลของมันยังคงประกอบด้วยสารกลุ่มอะมิโนและกลุ่มคาร์บอกซิลิกมันจึงสามารถสร้างพันธะเปปไทด์กับกรดอะมิโนตัวที่สามที่มีไตรเปปไทด์และอื่น ๆ เมื่อจำนวนของกรดอะมิโนมีขนาดค่อนข้างเล็กจะเรียกว่าโอลิโกเปปไทด์ในขณะที่ถ้าจำนวนของกรดอะมิโนเพิ่มขึ้นก็จะเรียกว่าโพลีเปปไทด์หรือโปรตีน
ในความเป็นจริงแม้จะมีรูปร่าง แต่เปปไทด์นั้นไม่ได้เป็นแบบธรรมดา แต่เสนอให้ 60% ต่อพันธะเดี่ยวและ 40% สำหรับพันธะคู่
ในสิ่งมีชีวิตการก่อตัวของพันธะเปปไทด์จะถูกเร่งโดยเอนไซม์ที่เรียกว่า peptidyl transferase - มีอยู่ในหน่วยย่อยสำคัญของไรโบโซม
นอกจากนี้โปรตีนที่นำมาใช้ในอาหารนั้นประกอบด้วยโซ่ของกรดอะมิโนที่เข้าร่วมโดยพันธะเปปไทด์ ในระหว่างการย่อยพันธบัตรเหล่านี้จะถูกทำลายโดยเอนไซม์เฉพาะ (peptidases) ที่มีอยู่ในน้ำย่อยและตับอ่อน กรดอะมิโนแต่ละตัวที่ถูกดูดซึมโดยลำไส้จะถูกส่งผ่านทางเลือดและถูกจับโดยเซลล์โดยเฉพาะอย่างยิ่งตับซึ่งจะรวมตัวกันผ่านพันธะเปปไทด์ใหม่เพื่อสร้างโปรตีนที่พวกเขาต้องการ (ไม่เพียง แต่โครงสร้างเท่านั้น แต่ยังเป็นฮอร์โมน .) ในความเป็นจริงมีโปรตีนจำนวนมากที่มีคุณสมบัติทางเคมีและฟิสิกส์ที่แตกต่างกันซึ่งมาจากคุณสมบัติที่แตกต่างกันของกรดอะมิโนสามัญ 20 ชนิดและจากการรวมกันของโซ่โพลีเปปไทด์ เพียงพอที่จะบอกว่าโปรตีน 100 กรดอะมิโนจึงค่อนข้างเล็กสามารถประกอบด้วย 20100 = 1.27 x 10130 โซ่โพลีเปปไทด์ที่เป็นไปได้ คำแนะนำในการสร้างกรดอะมิโนที่ถูกต้องนั้นอยู่ในจีโนมของแต่ละบุคคล
