โรคไข้สมองอักเสบญี่ปุ่นแพร่หลายในเกือบทุกภูมิภาคเอเชียและในบางภูมิภาคของโอเชียเนีย ความเสี่ยงในการได้รับเชื้อโดยทั่วไปนั้น จำกัด สำหรับนักท่องเที่ยวส่วนใหญ่อย่างไรก็ตามปลายทางระยะเวลาที่อยู่และกิจกรรมที่ดำเนินการในระหว่างการเข้าพักจะต้องนำมาพิจารณาด้วย
พื้นที่ที่มีความเสี่ยงส่วนใหญ่เป็นพื้นที่ชนบทและเกษตรกรรมโดยเฉพาะอย่างยิ่งพื้นที่ที่ได้รับการปลูกข้าวซึ่งเป็นโรคประจำถิ่น อย่างไรก็ตามกรณีในหรือใกล้ใจกลางเมืองนั้นไม่ได้หายากถ้ามีเงื่อนไขที่เอื้ออำนวยต่อการพัฒนาของยุง
ในเอเชียตะวันออกเฉียงใต้มีความเสี่ยงในการเจ็บป่วยเนื่องจากยุงกัดที่ติดเชื้ออยู่ตลอดทั้งปีโดยมีการเน้นที่ฤดูฝนมรสุมจนกระทั่งต้นฤดูแล้ง ในเขตอบอุ่นของจีนญี่ปุ่นและคาบสมุทรเกาหลีในทางกลับกันการส่งสัญญาณจะสูงขึ้นจากพฤษภาคม - กันยายน (ช่วงเวลาที่มีกิจกรรมที่ยิ่งใหญ่ที่สุดของสายการบิน) เมื่อเดินทางไปยังพื้นที่ที่มีอาการเฉพาะอาจแนะนำให้ฉีดวัคซีน
