กรดอะมิโนทั่วไปและเป็นครั้งคราว

กรดอะมิโนสามัญและการสังเคราะห์โปรตีน

กรดอะมิโนที่พบได้บ่อยที่สุดในโครงสร้างโปรตีนของสิ่งมีชีวิตเรียกว่ากรดอะมิโนสามัญหรือโปรตีน แม้ว่าในธรรมชาติจะรู้จักกรดอะมิโนมากกว่า 500 ชนิด แต่สิ่งที่เราเรียกว่าสามัญมีเพียงยี่สิบเท่านั้น นอกจากนี้ยังมีคนที่หายากบางคนเรียกว่า คนที่เป็นครั้งคราว ซึ่งโดยทั่วไปจะได้รับจากการเผาผลาญของคนธรรมดาหลังจากที่พวกเขารวมตัวกันในห่วงโซ่โปรตีน ในคอลลาเจนตัวอย่างเช่นไลซีนและโพรลีนกรดอะมิโนสองชนิดพบในรูปแบบไฮดรอกซิเลต (ไฮดรอกซีโพรลีนและไฮดรอกซีไซซีน)

ส่วนใหญ่ของกรดอะมิโนอื่น ๆ ที่ไม่ธรรมดาส่วนใหญ่จะประกอบด้วยเอนไซม์และฮอร์โมนของธรรมชาติโปรตีนหรือเปปไทด์ที่ดีกว่า (จำได้ว่าจะต้องพิจารณาเช่นนี้โปรตีนจะต้องประกอบด้วยกรดอะมิโนมากกว่า 100 ในขณะที่รูปแบบ oligo และ พอลิเปปไทด์เพียงพอจาก 2 ถึง 9 และจาก 10 ถึง 100)

ในบรรดากรดอะมิโนธรรมดา 20 ชนิดที่เราจำได้

Alanine, อาร์จินีน, แอสปาราจีน, กรดแอสปาร์ติน, ซิสเทอีน, Glycine, กรดกลูตามิก, กลูตามีน, ฮิสติดีน, Isoleucine, Leucine, ไลซีน, เมซีน, ฟีนอะลานีน

ตัวอย่างของกรดอะมิโนที่ไม่ธรรมดา ได้แก่ :

คาร์นิทีน (เกี่ยวข้องกับการขนส่งกรดไขมันสายโซ่ยาวภายในไมโทคอนเดรียนซึ่งพวกมันถูกใช้เพื่อผลิตพลังงาน);

ornithine, citrulline และ homocysteine ​​(พวกเขามีส่วนร่วมในการเผาผลาญของกรดอะมิโน - ยูเรียรอบ);

hydroxyproline และ hydroxylisine (รวมอยู่ในองค์ประกอบของคอลลาเจนและโปรตีนบางชนิด);

sarcosine (หรือ methylglycine)

กรดอะมิโนบางชนิดอาจมีความสำคัญทางการค้าหรือทางเภสัชวิทยา

• โซเดียมกลูตาเมตถูกนำมาใช้ในอุตสาหกรรมอาหารเพื่อเพิ่มรสชาติ (ดูสต็อกคิวบ์)
• L-dihydroxyphenylalanine (L-DOPA) เป็นยาที่ใช้รักษาโรคพาร์กินสัน

• 5-hydroxytryptophan (5-HTP) ถูกใช้สำหรับการรักษาอาการทางระบบประสาทที่เกี่ยวข้องกับ phenylketonuria (โรคทางเมแทบอลิซึมที่สืบทอดมาซึ่งป้องกันการใช้ฟีนิลอะลานีนซึ่งเป็นกรดอะมิโนที่จำเป็นเนื่องจากการขาดเอนไซม์โดยเฉพาะ ในเนื้อเยื่อมีความรับผิดชอบต่อความเสียหายร้ายแรงในระดับผิวหนังและระบบประสาท)

พืชและแบคทีเรียสามารถผลิตกรดอะมิโนโดยเฉพาะซึ่งสามารถพบได้ในยาปฏิชีวนะในเพปไทด์เช่น nisin และ alamethicin

กรดอะมิโนที่จำเป็น

กรดอะมิโนสามัญ 20 ชนิดบางชนิดเรียกว่าจำเป็นเนื่องจากร่างกายไม่สามารถสังเคราะห์จากสารประกอบอื่นได้ แต่ต้องนำมาพร้อมกับอาหาร

สำหรับมนุษย์เหล่านี้คือฟีนิลอะลานีน, leucine, isoleucine, lysine, methionine, threonine, tryptophan, valine และในเด็กฮิสทิดีนและอาร์จินีน

กรดอะมิโนสามัญ, ลักษณะทางเคมี

ขึ้นอยู่กับลักษณะทางเคมีของอนุมูลอิสระ (กลุ่มอะตอมที่มีสายโซ่ไม่ยาวมาก) กรดอะมิโนสามารถแบ่งออกเป็นหลายประเภท

กรดอะมิโนที่มี R apolar (ไม่สามารถสร้างพันธะไฮโดรเจน):

กับโซ่อะลิฟาติก: อะลานีน, leucine, isoleucine, valine, proline

ด้วยโซ่อะโรมา: ฟีนิลอะลานีน, ทริปโตเฟน

ด้วยโซ่ที่มีอะตอมกำมะถัน: เมไทโอนีน

กรดอะมิโนที่มีขั้ว R:

กับกลุ่ม OH: serine, threonine, tyrosine

กับกลุ่ม SH: cysteine

ร่วมกับกลุ่ม CO-NH _{2 กลุ่ม} : asparagine, glutamine

ด้วย H: glycine (กรดอะมิโนที่ไม่ใช่ chiral เท่านั้น)

กรดอะมิโนพื้นฐาน R:

ไลซีน, อาร์จินีน, ฮิสติดีน

กรดอะมิโนที่มีกรด R:

กรดกลูตามิกกรดแอสปาร์ติก