ปัจจุบันยังไม่มีวัคซีนที่เหมาะสมในการป้องกัน ไข้ Marburg ด้วยเหตุนี้จึงเป็นสิ่งสำคัญที่จะนำพฤติกรรมที่มีวัตถุประสงค์เพื่อหลีกเลี่ยงการติดเชื้อ
โดยเฉพาะอย่างยิ่งผู้ที่เดินทางไปยังประเทศที่มีการระบาดของโรคมาร์บูร์กจะต้องปฏิบัติตามแนวทางปฏิบัติด้านสุขอนามัยอย่างเคร่งครัดเช่นการล้างมือและหลีกเลี่ยงสิ่งของที่สัมผัสถูกที่สัมผัสกับคนป่วยหรือคนตาย ในกรณีที่มีไข้อย่างกะทันหันจำเป็นต้องติดต่อแพทย์ทันที องค์การอนามัยโลกยังไม่แนะนำให้กินเนื้อสัตว์จากสัตว์ป่าเช่นลิงชิมแปนซีหรือลิง
เพื่อหลีกเลี่ยงการส่งสัญญาณผู้ต้องสงสัยทุกรายต้องมีการแยกอย่างเข้มงวดในสถานที่ที่มีอุปกรณ์ครบครันและมีขั้นตอนการจัดการพิเศษนอกเหนือจากการใช้อุปกรณ์ป้องกัน (มาสก์หน้า, หน้ากากป้องกันใบหน้า, ชุดคลุมและถุงมือ)
