การใช้ยาเม็ดคุมกำเนิดอาจมีผลต่อค่าคอเลสเตอรอลในเลือด น้ำหนักของผลกระทบนี้ขึ้นอยู่กับชนิดของการคุมกำเนิดที่ใช้โดยเฉพาะอย่างยิ่งความเข้มข้นของเอสโตรเจนและโปรเจสโตรเจน เอสโตรเจนที่มีอยู่ในเม็ดคุมกำเนิดดูเหมือนจะเพิ่มระดับคอเลสเตอรอลที่ดี (HDL) เล็กน้อยในขณะที่ลดระดับเลวลง (LDL); ผลสุดท้ายคือการเพิ่มขึ้นของคอเลสเตอรอลรวมเล็กน้อยพร้อมกับการเพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสำคัญในไตรกลีเซอไรด์ progestogens ที่มีอยู่ในยาเม็ดคุมกำเนิดจะมีผลในทางตรงกันข้ามเนื่องจากมีแนวโน้มที่จะเพิ่มคอเลสเตอรอล LDL โดยการลดการแบ่งปัน HDL